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LargeTIFFTools: process very large TIFF files

Des logiciels open source de traitement d'images énormes (plusieurs gigapixels), telles qu'on en rencontre en pathologie numérique ou en imagerie spatiale, et développés au laboratoire IMNC, les LargeTIFFTools, ont été adoptés en décembre 2016 par la communauté de GNU/Linux et mis à disposition du public sous la forme de paquets pour les distributions de la famille de Debian et d'Ubuntu.

Les Jeudis de la Recherche - Rencontrez un chercheur dans son laboratoire

Depuis 2004, le Centre de la Vulgaristaion et de la Connaissance, en partenariat avec la faculté des sciences d’Orsay, le campus CNRS de Gif et la mairie de Gif-sur-Yvette, organise, pour le grand public, des visites de laboratoire et des rencontres avec des chercheurs sur des sujets de recherche actuels (le jeudi à 18h dans des laboratoires des campus d’Orsay et de Gif).

Gaël Latour, enseignant-chercheur au laboratoire IMNC, présentera son travail de recherche portant sur la cartographie des parchemins anciens à l'échelle microscopique sans contact, ni prélévement le 2 février 2017 à 18h au Laboratoire de Chimie Physique.

Séminaires Communs des Origines et de la Physique des 2 Infinis

Le Laboratoire d’Excellence Physique des 2 Infinis et des Origines (P2IO) organise conjointement avec les départements Physique des 2 Infinis (P2I) et Sciences de la Planète et de l’Univers (SPU) de l’Université Paris-Saclay une série de "Séminaires Communs des Origines et de la Physique des 2 Infinis" (SCOPI).

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Publications récentes

Design optimization and performances of an intraoperative positron imaging probe for radioguided cancer surgery

S. Spadola, M.-A. Verdier, L. Pinot, C. Esnault, N. Dinu, Y. Charon, M.-A. Duval and L. Ménard


Extent and accuracy of surgical resection is a crucial step in operable tumor therapy. Emergence of promising specific tumor-seeking agents labeled with positron emitters is giving rise to a renewed interest for radioguided surgery using beta probes. Beta detection, due to the particle short range, allows a more sensitive and accurate tumor localization compared to gamma radiotracers.

Optical properties of mice skull bone in the 455-705 nm range

Soleimanzad H, Gurden H, and Pain F


The activity of cell populations and networks is commonly recorded in vivo in rodents  with wide field optical imaging techniques such as intrinsic optical imaging, fluorescence imaging or laser speckle imaging. These techniques were recently adapted to unrestrained mice carrying transcranial windows. Furthermore, optogenetics studies would benefit from optical stimulation through the skull without implanting an optical fiber, especially for longitudinal studies.

Spectral and fluorescence lifetime endoscopic system using a double-clad photonic crystal fiber

A. Ibrahim, F. Poulon, F. Melouki, M. Zanello, P. Varlet, R. Habert, B. Devaux, A. Kudlinski, and D. Abi Haidar


We present a customized small-core double-clad photonic crystal fiber for spectral and fluorescence lifetime measurements of human samples. In this Letter, the new fiber has been characterized on different fluorophores and samples of human brain tumor; a comparison to a bi-fiber homemade system and a commercial fiber probe was made.

Voir l'article en ligne : ol-41-22-5214

Characterization of fiber ultrashort pulse delivery for nonlinear endomicroscopy

A. Ibrahim, F. Poulon, R. Habert, C. Lefort, A. Kudlinski, and D. Abi Haidar


In this work, we present a detailed characterization of a small-core double-clad photonic crystal fiber, dedicated and approved for in vivo nonlinear imaging endomicroscopy. A numerical and experimental study has been performed to characterize the excitation and collection efficiencies through a 5 m-long optical fiber, including the pulse duration and spectral shape. This was first done without any distal optics, and then the performances of the system were studied by using two kinds of GRIN lenses at the fiber output.
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